Seyyid Kutbiddin Cami ve Türbesi , Kökçüoğlu Semtindeki kabirliğin içerisindedir. Seyyid Kutbiddin'in kimliği ile ilgili net bir bilgi bulunmamakla birlikte Abdulkadir Geyşani Hazretleri'nin torunu olduğu söylenmektedir. Kendisi ve hayatı ile ilgili şöyle bir söylenti bulunmaktadır;
   1853 Seneninde Rus Donanmasının Sinop baskını esnasında 3-5 savaş gemesi de Samsun açıklarına kadar gelerek şehri topa tutar. Şehirde karşılık verecek bir kuvvet bulunmamaktadır. Ancak Seyyid Kutbiddin'in bulunduğu daha önceki kabirlikten top atışları ile karşılık verilir ve hasar alan Rus gemileri de geriye dönmek zorunda kalır. 
    Seyyid Kutbiddin Cami ve Türbesi tuğladan yığma olarak yapılmış tek katlı, kırma çatılı ve Marsilya kiremitli birleşik bir yapı konumundadır. Caminin kuzey ve doğusu "L" şeklinde ahşap kemerli son cemaat yeri ile çevrilidir. Tavan ve taban döşemeleri ahşap olup, gömme tavan göbeği mevcuttur. Yapının girişinde M. 1292 seneninde yapıldığı yazmaktadır. Caminin güney istikametteki duvarına bitişik durumda türbe bulunmaktadır. Beşik tonozlu mekanda tek bir sandukadan oluşan türbenin içinde M. 1404 seneninde yapıldığına değin sonraki onarımlarda yazılmış bir Arapça metin bulunmaktadır. Bu onarımlar sırasında türbe ve caminin tuğla duvarları travertenle kaplanmış, caminin kemerli son cemaat yeri vitrinle kapalı hale getirilmiş, ahşap tavan yenilenmiştir. Cami yuvarlak kemerli pencerelerle aydınlatılmıştır. Samsun'un en eski kabirliklerinden biri olan ve içinde Selçuklu ve Osmanlı kabir taşlarının ve mezar yapılarının bulunduğu kabristan alanı ise geniş bir alana dağılmaktadır.